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【教学科研】林学院朱天辉团队在《Genomics》上发表重要论文

来源: 2020-06-30 20:04:27

我院朱天辉团队在国际期刊《Genomics》上发表题为“Whole-genome sequence ofArthrinium phaeospermum, aglobally distributedpathogenic fungus”的研究论文,获得了世界性病原真菌—暗孢节菱孢菌的全基因组及功能注释、次级代谢产物等信息,阐明了该菌系统进化、蛋白家族、特有基因等的特征,并掌握了致病过程的重要通路和关键效应因子。

暗孢节菱孢菌是由朱天辉研究团队2007年首次在省内大面积枯死的杂交竹上发现,该病原是一种广泛性病原菌,除对包括竹类在内的56种植物有强致病性外,还能造成动物和人皮肤大面积溃烂。团队现已完成该病害发生危害与分布规律、病原系统发育与致病机理、症状发生发展情况、综合防治措施等全面且系统性研究。然而,暗孢节菱孢菌在基因组及致病基因方面还有所欠缺。本论文通过PacBio RS II测序平台,获得暗孢节菱孢菌基因组大小48Mb,19个scaffold,19个contig,GC含量53%。通过NR、KOG、KEGG等数据库注释的共有基因有4731个,涉及基因最多的通路主要有:次生代谢产物的生物合成途径、抗生素生物合成途径、氨基酸生物合成途径等。在基因功能方面,分泌蛋白有1721个,次级代谢产物基因簇有66个,致病相关基因有3611个。在系统进化方面,基因家族有5886个,特有基因高达9686个,与Apiospora montagnei亲缘关系较近。本论文是节菱孢属真菌的第一个全基因组测序物种,研究结果有助于后续深入研究该属真菌系统进化、致病基因功能、次级代谢物调控途径等。

《Genomics》2019年影响因子为6.205。该论文以拉斯维加斯网站为第一和通讯单位,我院青年教师李姝江为第一作者,朱天辉为通讯作者,该研究得到国家自然科学基金青年基金项目、中国博士后基金、四川省科技厅基础应用研究项目资助。本研究团队一直致力于林木重大病害的病原及致病机理、病害生物防治方面的研究,近5年在中科院分区1区top期刊发表研究论文12篇。

全文链接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0888754318307341



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